Poden existir complicacións que precisen ingreso hospitalario ou cirúrxico nun 30-40% dos casos de Enfermidade de Chron, e de ata un 5-10% dos casos de colite ulcerosa
O procedemento, ademais de axilizar o diagnóstico, evita posibles complicacións postoperatorias ao no ser necesario un acto cirúrxico, realizándose de xeito ambulatorio, mediante sedación e sen necesidade de ingreso